脑出血后脑损伤的基因表达谱改变及相关小分子药物预测

摘要：

目的 研究脑出血(ICH)后局部脑组织的基因表达谱改变,为ICH的治疗提供靶点;以及预测可能用于ICH治疗的小分子化合物.方法 从GEO数据库中下载GSE24265数据集,其中包括4个血肿周围组织和7个对侧脑组织(4个对侧白质,3个对侧灰质)的芯片数据.对数据进行归一化后,以log2FC＞1和P＜0.05为标准,筛选差异基因;对差异基因进行GO和KEGG分析.为了明确差异基因之间的关系,构建PPI网络.用CMap分析可能用于ICH治疗的小分子化合物.结果 经过分析共得到69个差异基因,其中28个为上调基因、41个为下调基因.GO分析显示,ICH相关的差异基因主要的生物学过程有白细胞迁移、炎症反应、细胞粘附和信号转导等.KEGG分析得到了与ICH最显著相关的信号通路,包括cAMP信号通路、白细胞跨内皮迁移、松弛素信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用等.PPI网络显示关键的节点基因有IL-1β、MMP-9、ITGAM、CAV1、KIT.CMap分析得到了5种可能用于ICH治疗的小分子化合物.结论 本研究获得了ICH后表达水平显著改变的基因,如PROCR、HSD11B1、CTNNAL1、RPS4Y1、EIF1AY、KDM5D等.通过分析这些基因参与的信号通路和蛋白互相作用网络中的关键节点,得到了5种ICH治疗的候选药物.

关键词：脑出血;差异表达基因;蛋白质相互作用网络;CMap

所属期刊栏目：18

分类号：R651;R743.34(外科学各论)

资助基金：哈尔滨科技创新人才基金2017RAXXJ042

在线出版日期：2021-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：616-621,626