基于GEO数据库的精神分裂症长链非编码基因LINC01020的筛选验证及其靶蛋白预测

摘要：

目的:通过生物信息学方法识别与精神分裂症发生发展相关的长链非编码基因.方法:从GEO数据库中获取GSE17612基因芯片中28例精神分裂症患者和23名健康对照者大脑前额叶皮质(aPFC)转录数据,并通过生物信息学方法找出差异表达的长链非编码基因LINC01020,通过利用荧光定量PCR技术验证LINC01020在精神分裂症患者和健康对照者中的表达水平,通过NCBI数据库查询LINC01020的核酸序列,运用LncLocator在线网站进行亚定位预测,CatRAPID数据库进行蛋白结合位点预测,再对其靶蛋白进行蛋白网络互作分析,找出其关键蛋白.结果:精神分裂症患者aPFC内LINC01020表达上调,在精神分裂症患者外周血浆中,该基因表达水平下调,与脑组织中的表达水平呈反向联系,亚细胞定位在细胞质中,可与2064个编码蛋白发生作用,其中关键蛋白是核糖体蛋白家族.结论:LINC01020在精神分裂症脑前额叶皮质中和血浆中均有显著差异表达,与精神分裂症密切相关,定位在胞质中的LINC01020可能通过多作用位点广泛参与信使RNA转录,剪接,代谢等多种转录后调控机制参与精神分裂症的发生发展机制.

关键词：精神分裂症、GEO数据库、LINC01020、生物信息

所属期刊栏目：33

分类号：R749.3(神经病学与精神病学)

资助基金：张家港市科技局项目ZKS1926

在线出版日期：2023-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：188-192