角毛壳菌降解粗纤维基因的筛选

摘要：

以角毛壳菌菌丝体为材料,构建cDNA文库并进行了部分表达序列标签(ESTs)的分析.文库的滴度为1.02×106 pfu/mL,重组率为 95.3%,插入片段平均长度大于 1.2 kb.在cDNA文库中随机选择克隆从5'端测序得到 1 219 个高质量ESTs,拼接为804条独立基因.其中460条(57.2%)与NCBI中非冗余蛋白质库(NR)已知基因有不同程度同源性的代表已知功能基因,344(42.8%)条独立基因与NR库中基因没有显著同源性的代表未知功能新基因.从已知基因中鉴定出了降解粗纤维的基因:β-1,4-内切葡聚糖酶基因、β-葡萄糖苷酶基因、β-内切木聚糖酶基因、木糖苷酶基因、漆酶基因.

关键词：角毛壳菌菌丝体、cDNA文库、表达序列标签、生物信息学分析、降解粗纤维基因

所属期刊栏目：27

分类号：TQ352

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2003AA241140

在线出版日期：2007-07-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：21-26