肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁外泌体microRNA的检测及生物信息学分析

摘要：

目的 检测肝泡型包虫病侵及胆道患者胆汁中外泌体microRNA(miRNA)的表达情况,探索差异miRNA对靶基因的调控机制.方法 收集自2017年8月-2018年10月就诊于青海大学附属医院的12例肝泡型包虫病患者胆汁样本,观察组(有胆道受侵表现)与对照组(无胆道受侵表现)各6例.经超速离心法提取、Western Blot鉴定两组胆汁中的外泌体结构,采用Trizol法提取外泌体总RNA,再经miRNA表达谱芯片实验检测并寻找差异表达的miRNA.根据差异miRNA预测胆道侵犯靶基因,并进行通路富集分析.结果 观察组与对照组比较,共有74个差异表达的miRNAs,其中9个表达上调,65个表达下调(|Fold Change|>2).经Pathway分析,靶基因主要富集在肿瘤发生、磷脂酰肌醇信号系统、PTEN等通路中(FDR<0.05).经GO注释及富集分析,靶基因主要富集在基因抑制的正向调控、调控细胞分化等生物过程(FDR<0.05).结论 建立肝泡型包虫病合并胆道侵犯胆汁中外泌体差异miRNA表达谱,可作为泡型包虫病侵及胆道的生物学标志物,初步阐释了肝泡型包虫病侵及胆道后差异miRNA对靶基因的调控机制.

关键词：棘球蚴病、肝、胆汁、外泌体、微RNAs、计算生物学

所属期刊栏目：36

分类号：R532.32(寄生虫病)

资助基金：青海省科技厅重大科技专项;第二批青海省”高端创新人才千人计划”培养拔尖人才项目;青海大学中青年科研基金项目;青海大学附属医院中青年科研基金重点项目

在线出版日期：2020-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2045-2049