基因间长链非编码RNA RP11-488L18.10在胆管癌中的表达及其与预后的关系

摘要：

目的 筛选胆管癌(CCA)中关键基因间长链非编码RNA(lincRNA),并研究其表达与患者预后的关系.方法 CCA表达量和临床数据来自于人类癌症基因组图谱(TCGA).数据集GSE107943 CCA表达数据获取自高通量基因表达数据库(GEO).利用R软件进行差异性基因分析,确定肿瘤和正常样品之间显著差异性表达的lincRNA;筛选关键lincRNA.使用受试者工作特征曲线(ROC曲线)分析基因表达对CCA的诊断意义.使用Kaplan-Meier生存曲线分析患者预后.基因富集分析分析显著富集分通路.实时荧光定量PCR验证临床样本中基因表达.结果 通过筛选得到451个同时在TCGA和GSE107943数据集上调的lincRNA和154个同时两个数据集下调的lincRNA.在TCGA和GSE107943数据集中lincRNA RP11-488L18.10在肿瘤组织中丰度较高.利用TCGA和GSE107943数据集对lincRNA RP11-488L18.10的表达与CCA的关系进行ROC曲线分析,结果 显示,TCGA中AUC=1,P<0.0001;在GSE107943中AUC=0.9469,P<0.0001.在TCGA中,lincRNA RP11-488L18.10的高表达可以显著预测CCA的总生存率(P=0.016)和无复发生存率(P=0.017);在GSE107943中,lincRNA RP11-488L18.10的高表达可以显著预测CCA的总生存率(P=0.023)和无复发生存率(P=0.005).lincRNA RP11-488L18.10与微型染色体维持蛋白2呈显著正相关.相对于癌旁组织,CCA组织中lincRNA RP11-488L18.10(P=0.010)和MCM2(P=0.023)均高表达.结论 lincRNA RP11-488L18.10与CCA的发生及预后密切相关,有望成为CCA诊断和治疗的作用靶点.

关键词：胆管肿瘤、RNA、长链非编码、预后

所属期刊栏目：36

分类号：R735.8(肿瘤学)

在线出版日期：2020-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1087-1090