基于靶基因比较microRNAs与HBV蛋白的作用模式

摘要：

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是当前严重威胁人类健康的病毒性疾病之一.近年来许多研究证实microRNA (miRNA)可以介导宿主与病毒之间的相互作用,阐明miRNA在HBV感染中的作用有助于新型治疗策略的提出.然而,miRNA的多靶点特性限制了其功能研究.为了研究miRNA对HBV的调节机制,本文在靶基因水平上比较了HBV相关miRNA和HBV蛋白的功能谱、采用半定量手段进行分析并从网络层面挖掘其潜在作用模式.结果表明,在靶基因上,miRNA功能较为集中,HBV蛋白的作用效应可能更为广泛；在网络拓扑结构上,miRNA主要通过直接作用于HBV蛋白的靶基因及其邻居节点达到其调节作用；在生理效应上,miRNA在凋亡、细胞周期以及体液免疫的调节上呈现出拮抗HBV蛋白效应的趋势.本研究不仅为miRNA的功能研究提供了一种良好的方法,而且miRNA在HBV感染中的作用模式有助于今后基于miRNA的乙肝治疗方案的提出.

关键词：乙肝、microRNA、HBV蛋白、靶基因、GO、网络

所属期刊栏目：57

分类号：R512.62(传染病)

资助基金：国家自然科学基金30900832;肝肾疾病病证教育部重点实验室上海中医药大学开放课题;上海市教委"曙光计划"07SG22;教育部新世纪优秀人才计划NCET-08-0399;国家科技重大专项2012ZX10005001

在线出版日期：2012-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1755-1762