玉米CACTA型转座子携带宿主基因片段转移新功能的发现与特性分析

摘要：

携带宿主基因片段转座子的转座对基因组扩增、新基因产生具有重要作用.本研究以参与玉米维生素E合成的基因HGGT为例,采用生物信息学方法,寻找携带宿主基因片段转座子,并分析其特性.通过BLAST搜索和基因注释,发现了3个携带HGGT基因不同部位片段的ENSPM2_ZM转座子.利用公共数据库,在玉米自交系B73基因组中发现了另外66个能携带宿主基因片段的转座子.这69个转座子分布在10条染色体上,平均长度为3689 bp.其中,有9个转座子携带了2个来源的宿主基因片段.通过比对玉米EST数据库,发现至少13个转座子可以转录,且2个携带不同来源宿主基因片段的转座子具有融合转录的特征.

关键词：CACTA转座子、基因片段、基因组分布、嵌合转录本、玉米

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分类号：S5(农作物)

资助基金：国家自然科学基金30500322;国家高技术研究发展计划863计划2006AA102183;2006AA10A107

在线出版日期：2009-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：177-186