H5N1血凝素蛋白切割位点的序列研究

摘要：

血凝素(hemagglutinin, HA)能否被切割成HA1和HA2是决定禽流感病毒高致病性的重要因素.分析切割位点的序列, 研究其进化规律可以让我们更深入地了解H5N1的高致病性.本研究先通过元胞自动机的方法将HA的基因序列转化为图形, 并在图上找到了一段H5N1亚型仅有的特征基因片段.这个特征基因片段包含30个碱基, 主要由A和G组成, 其对应的氨基酸主要是带正电荷的碱性氨基酸.这个特征氨基酸片段正好处于HA的酶切位点上.通过3D结构的同源模拟, 发现H5N1 HA蛋白的切割位点较为暴露, 非常有利于各种酶对其进行剪切.本研究还构建了切割位点的分子表面, 以进一步分析可能的氨基酸突变将如何影响表面的电荷分布.结果表明, 某些突变较大地改变了电荷的表面分布, 可能使病毒失去高致病性.H5N1特征氨基酸片段突变情况的统计表明, 在时间上, 2005年突变案例的比例比前几年上升了许多; 而在地域上, 中国大陆的突变病毒案例占了绝大比例.这些结果都有助于我们研究病毒高致病力的进化情况.

关键词：H5N1血凝素、切割位点、元胞自动机、特征氨基酸片段、同源模拟

所属期刊栏目：52

分类号：Q5(生物化学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2005CB724303;国家自然科学基金10376024;天津市科委科技计划033801911

在线出版日期：2007-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1908-1912