序列比较分析揭示水稻Pms1区段基因组的快速进化

摘要：

以前的研究将水稻光敏核不育位点Pms1定位在第7染色体上.本研究对来源于定位亲本(明恢63和农垦58)的两个BAC克隆进行比较测序,以鉴定Pms1的候选基因;并通过对两个克隆的注释和比较得到5个候选基因,以进行进一步的功能检验.将这两个亲本的基因组序列与公共数据库里的日本晴和93-11比较分析,结果显示,该区段4个亲本在序列组成上存在巨大差异,这种差异主要归咎于活性反转座成分造成的基因组新近增长和变异;亚种内和亚种间以Indel或者SNP的形式存在高度的多态性.利用反转座成分的两个长末端重复进行分析发现,它们的替换速率比已有的报道要高得多.该结果证明,在自然和人工选择的共同作用下,Pms1区段正处于快速的基因组进化过程中.

关键词：光敏感雄性核不育、基因组结构、反转录转座子、插入年代估计、选择

所属期刊栏目：52

分类号：S5(农作物)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2006AA10A103;国家自然科学基金30321005

在线出版日期：2007-10-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：540-547