阈性状QTL定位的系谱传递不平衡检验

摘要：

阈性状是具有一定生物学意义和经济价值的性状,其表型分布不连续,遗传基础与数量性状相同.由于阈性状的特殊性,传统的数量性状QTL定位方法不能有效地对其进行QTL定位.在人类疾病定位方面广泛采用的是传递不平衡检验(TDT),它以简便和高效得到了应用和扩展.但TDT只能利用独立的核心家系,对综合了父母、同胞及其他亲属信息的扩展系谱,TDT在使用时会损失大量信息,故难以推广,尤其在动物群体中难以应用.针对此,Martin提出了PDT方法,它能有效地对人类扩展系谱进行分析.在此基础上,将PDT方法移植到畜禽阈性状QTL定位中,并针对畜禽的特点,对PDT方法进行了适当修正,提出了系谱传递不平衡检验(PTDT).利用Monte Carlo方法,模拟了多种参数组合下,PTDT的检验功效和Ⅰ型错误.结果表明,PTDT是一个稳健、有效的阈性状QTL定位方法,其Ⅰ型错误接近于显著性水平(P<0.05),大多数情况下,PTDT的检验功效接近于1.0.在父母信息部分缺失的情况下,PTDT的Ⅰ型错误和检验功效与未缺失时基本相同.在资料信息有限的情况下,PTDT的检验功效高于PDT,且Ⅰ型错误低于PDT.模拟结果同时表明在粗糙定位的基础上,PTDT可作为QTL精细定位的新策略.

关键词：阈性状、QTL定位、系谱传递不平衡检验、扩展系谱

所属期刊栏目：49

分类号：Q3(遗传学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划G200001603;国家自然科学基金30025003;国家高技术研究发展计划863计划2001AA243011

在线出版日期：2004-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1166-1171