扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生

摘要：

通过酶切、克隆、测序, 结合Long-PCR和Primer Walking 法对扬子鳄线粒体DNA基因组进行全序列测定.结果表明, 扬子鳄线粒体基因组DNA序列全长为16746 bp, 其基因组碱基组成为29.43% A, 24.59%T, 14.86%G, 31.12%C.与其他大多数脊椎动物相同, 其基因组由13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、 22个tRNA基因及1个非编码的控制区(D-loop)组成.基因的排列与已测序的鳄类相似.在全序列分析的基础上, 对12S rRNA基因序列、16S rRNA基因序列、蛋白质编码基因序列及其合并数据用MP法和ML法构建系统发生树, 结果表明扬子鳄与密河鳄的亲缘关系较近, 支持传统观点.根据ML树的支长数值估计钝吻鳄属发生的时间为74.9 MaBP, 扬子鳄与密河鳄分歧的时间为50.9 MaBP.

关键词：扬子鳄、线粒体基因组、全序列、系统发生、分歧时间

所属期刊栏目：48

分类号：Q95(动物学)

资助基金：教育部高校骨干教师资助计划GG-180-21002403-1740;教育部留学回国人员科研启动基金

在线出版日期：2004-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1954-1958