应用抑制差减杂交法分离水稻幼穗发育早期特异表达的基因

摘要：

以水稻茎尖分生组织(shoot apical meristem, SAM)为对照群体, 幼穗分生组织(primary and secondary branch primordia, Pb/Sb)为目标群体, 进行抑制差减杂交.用经过SAM cDNA差减的Pb/Sb cDNA群体构建了一个差减文库. 通过差示筛选鉴定了40个在Pb/Sb中特异表达或表达增强的候选克隆.Northern杂交验证, 至少40%的候选克隆代表了在Pb/Sb中特异表达或表达增强的基因, 同时, 相当一部分克隆为低丰度转录本.对40个cDNA克隆单向测序后, 与GenBank中同源序列进行比较, 结果表明: 2个克隆为已知水稻基因;11个克隆与已知基因的同源性为60%~90%;另有18个克隆在GenBank 中无法查到对应的同源基因, 可能代表了新基因, 或是由于序列位于变异丰富的3′端故而无法查到与其他物种基因的同源性.目前为止, 已有19个基因在GenBank注册并获登录号.

关键词：抑制差减杂交技术、茎尖分生组织、幼穗分生组织

所属期刊栏目：45

分类号：S5(农作物)

资助基金：中国科学院资助项目39770047

在线出版日期：2004-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1392-1397