基于RNA测序的SHED体外连续扩增后差异表达基因的研究

摘要：

目的:利用RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)技术研究人脱落乳牙干细胞(stem cells derived from human exfoliated deciduous teeth,SHED)体外长时期扩增至20代(P20)后基因表达的差异,初步探讨其体外扩增衰老相关的信号通路.方法:从健康儿童脱落的乳牙中分离牙髓干细胞,在常规条件下将其扩增培养至20代,利用RNA-seq筛选出差异表达的基因,并对其进行相关生物学信息分析,寻找SHED体外连续扩增衰老相关的信号通路.结果:RNA-seq结果显示,SHED第 4 代(P4)和P20 代差异表达的基因共有 1 884 个,其中上调表达的基因有 575 个,下调表达基因 1 309 个,这些差异表达的基因分布在生物过程(biological progress,BP)、细胞组成(cellular component,CC)和分子功能(molecular function,MF)等生物学过程中.早、晚期代次的SHED差异基因及相关蛋白之间的作用主要富集在剪接体、核糖体、细胞周期、p53 通路相关的信号通路上.结论:本研究揭示了SHED体外连续扩增培养至第 20 代后基因表达谱的改变,为后续进一步研究其细胞体外衰老机制指明了方向.

关键词：人脱落乳牙干细胞、体外连续扩增培养、RNA测序、细胞衰老

所属期刊栏目：33

分类号：R782;R788(口腔科学)

资助基金：上海市闵行区自然科学研究课题2020MHZ030

在线出版日期：2023-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：211-218