基于自噬相关基因建立和验证口腔鳞状细胞癌的预后风险评分模型

摘要：

目的:构建自噬相关基因(autophagy-related genes,ARGs)的预后风险评分模型,预测口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)的生存率.方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中检索差异表达的ARGs,通过Cox回归分析及套索(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析确定预后的ARGs,构建总生存期(overall survival,OS)风险评分模型.根据中位风险评分将TCGA数据库和基因表达汇编(gene expression omnibu,GEO)数据库中所有病例归类为低风险组和高风险组,使用Kaplan-Meier(K-M)法分析高、低风险组的OS,通过描述高、低风险组患者风险评分分布、生存状态分布和基因表达模式论证风险评分模型的准确性.构建列线图定量估计OSCC患者的生存率.通过免疫细胞浸润差异分析探讨该模型预测OSCC预后的潜在机制.结果:筛选出37个差异表达的ARGs,构建了由6个预后ARGs(BID、DDIT3、VEGFA、FADD、BIRC5和NKX2-3)组成的OSCC预后风险评分模型,该模型可作为OSCC潜在的独立预后因素.构建了列线图预测患者OS,校准曲线以图形方式验证了实际生存率与列线图预测的生存率之间的一致性.结论:本研究构建的风险评分模型和列线图可以为预测OSCC患者预后提供参考,并且这有助于理解自噬影响OSCC发生、发展的机制.

关键词：口腔鳞状细胞癌、自噬、预后、风险评分、列线图

所属期刊栏目：32

分类号：R782;R739.8(口腔科学)

资助基金：山东省自然科学基金项目;山东省自然科学基金项目

在线出版日期：2023-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：343-353