小鼠上下颌骨发育差异性表达基因的生物信息学分析

摘要：

目的：上、下颌骨的发育差异可能是由于两者差异性地表达某些基因而造成的。本文拟对E9.5（胚胎第9.5天）小鼠上、下颌弓差异性表达的基因进行系统的生物信息学分析。方法：从GEO 数据库获取E9.5小鼠上、下颌弓差异性表达的基因，应用DAVID和GeneMANIA数据库分析这些基因之间的相互关系。结果：经过DAVID数据分析，这些在E9.5小鼠上、下颌弓差异性表达的基因被富集到不同的生物学过程或分子功能的子集中，如“转录因子活性”、“系统发育”和“骨骼系统发育”等。其中BTB7B、SOX10、TSHZ2、GSC、GLIS2、MEIS1、CITED2、IRF9、BARX1、MSX1、DLX6、CSRNP1、HEYL、MKX、PITX1和NFIB，这16个基因被富集到“转录因子活性”这一分子功能子集。通过GeneMANIA数据库分析，建立了这16个基因及一些预测基因的分子网络图，显示这些基因存在直接或间接的相互作用。结论：上、下颌骨在发育过程中存在许多差异表达的基因，其中对上、下颌骨特异性发育具有重要调控作用的16个转录因子包括 BTB7B、SOX10、TSHZ2、GSC、GLIS2、MEIS1、CITED2、IRF9、BARX1、MSX1、DLX6、CSRNP1、HEYL、MKX、PITX1和NFIB，它们彼此密切相关且相互作用形成调控网络。在研究上、下颌骨差异性发育的分子调控机制时，需要关注由这些基因形成的调控网络。

关键词：上颌骨、下颌骨、发育、基因、生物信息学分析、小鼠

分类号：Q343(遗传学分支学科)

在线出版日期：2015-01-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：418-424