乙酰胆碱受体δ、γ亚基上Loop F高可靠性结构模型的构建

摘要：

报导从单斑眼镜蛇(monocellete cobra,Naja kaouthia)毒中分离纯化出一个新的短链神经毒cobrotoxin c(CBT C),并确定了一个新的功能氨基酸Arg56.根据笔者测定的NMR液相三级结构和近年来神经毒素与受体结合机制研究的进展,推断Arg56及公认的功能残基Lys27、Lys47一起与α1型乙酰胆碱受体δ/γ亚基上的Loop F相互作用.基于此,笔者以MODEILER 6V2软件构建了这种蛇毒的包括CBT C在内的五个短链神经毒与Loop F结合的模型.五个模型中的Loop F结构具有高度的一致性,RMSD值在0.22 nm左右,从而断定此模型有较高的可靠性.构建出的Loop F的结构模型将对构建高可靠性α1型AChR结构模型、研究离子通道开闭机制等都具非常重要的意义.

关键词：短链神经毒、乙酰胆碱受体、Loop F、柔性分子对接

所属期刊栏目：29

分类号：Q716(生物大分子的结构和功能)

资助基金：国家自然科学基金39670165

在线出版日期：2004-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：185-189