茶树EST资源中SSR的信息分析

摘要：

从NCBI公共数据库下载获得1989条茶树EST,去除其中的低质量的和冗余的序列,得到全长为734.54 kb的1589条无冗余EST.共在这些序列中发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%.这些EST-SSR的平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb.茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复.本研究为茶树EST-SSR标记的建立和进一步应用奠定了基础.

关键词：茶树、EST-SSR、频率、特性

所属期刊栏目：22

分类号：Q74(生物小分子的结构和功能)

资助基金：浙江省杭州市农业科学院基金120504

在线出版日期：2006-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：471-476