锈色棕榈象气味结合蛋白的同源建模

摘要：

[目的]锈色棕榈象Rhynchophorus ferrugineus为危害棕榈科植物的重要入侵害虫,为获得该害虫气味结合蛋白(Odorant binding protein,OBP)的三维结构,从而基于计算反向化学生态学方法筛选潜在对该害虫行为具有调控作用的挥发物用于防控奠定基础.[方法]以蛋白质数据库中已经报道的昆虫OBP晶体结构为模板,采用同源建模方法构建获得了该害虫2个OBP的三维结构.模建结构通过Procheck、Verify_3D和ERRAT进行评价,得到的评估分值均表明模建结构质量高.[结果]三维模建结构显示,这2个锈色棕榈象OBP由6个 α-螺旋和连接这些螺旋的回折构成,6个半胱氨酸形成的3对二硫键起到了稳定结构的作用.[结论]模建结构的获得,为今后通过分子对接筛选潜在的活性挥发物用于防控锈色棕榈象奠定了基础.

关键词：气味结合蛋白、同源模建、三维结构、锈色棕榈象

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分类号：S433.3;O641.4;Q968.1

资助基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;安徽省农科院院创新团队项目

在线出版日期：2018-01-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：909-914