麻竖毛天牛线粒体基因组测定及天牛科线粒体基因组比较分析

摘要：

[目的]线粒体基因组分析是研究昆虫系统发育的重要手段.本研究通过测定麻竖毛天牛Thyestilla gebleri(Faldermann,1835)线粒体基因组,比较分析天牛科Cerambycidae线粒体基因组的特征,进而初步探讨麻竖毛天牛系统发育地位和天牛科部分类群之间的系统进化关系.[方法]采用引物步移法测定麻竖毛天牛线粒体基因组全序列.参照GenBank收录的16种天牛线粒体基因组序列进行基因注释;采用在线软件tRNAscan-SE Search Server对转运RNA(tRNA)的二级结构进行了预测.通过对16种天牛的线粒体基因组进行重新注释,结合本研究获得的麻竖毛天牛线粒体基因组进行序列特征比较分析.基于11个蛋白编码基因的核苷酸序列,利用最大似然法构建了天牛科17种天牛的系统发育树.[结果]麻竖毛天牛线粒体基因组全长15 505 bp,A+T含量为74.07％,包含13个蛋白编码基因(PCGs),2个核糖体RNA(rRNA)基因,22个tRNA基因和一个长度为872 bp的控制区,未发现基因重排.通过比对17种天牛的线粒体基因组,发现长翅暗天牛Vesperus conicicollis-个tRNA(trn P)基因的移位.17种天牛的tRNA中,trnSl(AGN)的D臂均缺失,其余tRNA都具有典型的三叶草结构.大部分种类的蛋白编码基因起始密码子为典型的ATN(ATA、ATT、ATC、ATG),只有部分种类的Nadl、COI、ATP8基因存在特殊的起始密码子(TTG、AAC、AAT、GTG),终止密码子均为常见的TAR(TAA、TAG)或不完全的T和TA.系统发育树中,6个亚科分别单独分支,其中,麻竖毛天牛与云斑白条天牛Batocera lineolata聚为一支.[结论]麻竖毛天牛线粒体基因组符合天牛线粒体基因组的一般特征;除少数tRNA基因存在重排外,天牛科线粒体基因排列相对稳定;基于线粒体基因组的系统发育分析支持天牛科6个亚科的单系性,麻竖毛天牛和云斑白条天牛亲缘关系较近.

关键词：麻竖毛天牛、天牛科、线粒体基因组、系统发育

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分类号：Q963;S763.38;S511

资助基金：转基因生物新品种培育科技重大专项No.2018ZX08021001

在线出版日期：2017-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：755-766