蟋蟀肠道细菌多样性的宏基因组分析
[目的]了解油葫芦属蟋蟀成虫前中肠和后肠肠道细菌的多样性.[方法]首先,基于mtDNA-16S rRNA基因对蟋蟀进行分子鉴定,然后从蟋蟀前中肠和后肠分别提取总DNA,再使用Illumina Miseq平台进行细菌16S rRNA v3-v4变异区进行测序,最后分析蟋蟀肠道微生物的群落组成和多样性.[结果]蟋蟀mtDNA-16S rRNA基因分析结果显示归属于油葫芦属,暂时命名为平顶山油葫芦.细菌16S rRNA基因宏基因组测序分析,前中肠共获得21799条reads,857个操作分类单元(Operational taxonomic unit,OUT),后肠获得16515条reads,2155个OUT.99%的蟋蟀肠道细菌归属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes).前中肠归入232个属,前5个属分别是:乳球菌属(33.47%),泛菌属(21.50%),肠杆菌属(15.47%),沃尔巴克体属(9.47%)和魏斯菌属(5.34%);后肠归入152个属,前5个属分别是:未分类的瘤胃球菌科成员(Unclassified Ruminococcaceae)(30.07%),Parabacteroides(10.93%),Incertae sedis(9.74%),Alistipes(5.86%),类杆菌属(5.50%),Dysgonomonas(4.91%).[结论]mtDNA-16S rRNA是油葫芦属分子鉴定的有效工具.蟋蟀肠道含有丰富的微生物资源,为后续的肠道微生物资源开发奠定了基础.
油葫芦属、MtDNA-16S rRNA、肠道细菌、多样性、16S rRNA
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Q938.1;X172;R780.2
平顶山学院高层次人才科研启动基金;河南省高等学校重点科研项目;平顶山学院病原生物学重点学科;中央财政支持项目;嵩山地区野生动物常规普查
2017-07-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共9页
417-425