基于DNA条形码的物种界定算法比较研究——以北京周边地区舟蛾科为例
[目的]为了探究3种常用物种界定方法(jMOTU、ABGD、GMYC)的界定效果.[方法]本研究以中国北京周边地区10个采样点483个舟蛾科样品为例,利用线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基基因(Cytochrome c oxidase subunit geneⅠ,COⅠ或COX1,约650 bp)的部分序列,进行3种物种界定算法(jMOTU、ABGD、GMYC)的实例比较研究.[结果]3种物种界定方法的鉴定效力存在差异,与形态学结果相比较,ABGD方法划分物种的准确率为100%,基于BEAST的GMYC模型结果与形态学结果一致,产生的置信区间(64~68)覆盖了形态学的结果(67).然而,基于d8tree/MPLtree的GMYC方法倾向于高估MOTUs,jMOTU方法倾向于低估物种数目.[结论]结果显示,ABGD方法和基于BEAST的GMYC模型方法对于本文研究对象舟蛾科能够较好地划分,可以对基于形态学的物种界定进行有效补充.
舟蛾科、DNA条形码、物种界定、GMYC、ABGD、jMOTU
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Q959.2262;R282.5;TP311
国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;创新项目
2017-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
13-21
