感染球孢白僵菌的烟粉虱若虫免疫应答转录组分析
【目的】筛选烟粉虱 Bemisia tabaci (Gennadius)若虫应对白僵菌 Beauveria bassiana 侵染的应答基因,以进一步研究烟粉虱免疫反应的分子机制。【方法】采用新一代高通量测序技术对感染和非感染白僵菌的烟粉虱4龄若虫进行了测序分析,并筛选了差异表达基因;利用生物信息学工具对转录组测序得到的基因进行了功能注释、分类以及参与的信号通路展示。【结果】组装得到非冗余 Unigene 232554个,其 N50和 N90分别为1153 bp 和260 bp,平均长度为67424 bp。对所有的基因进行差异表达分析发现:以 P<0.05为标准筛选得到了1166个差异表达基因,其中上调表达基因有474个,下调表达基因有692个,其中,与免疫相关的基因有405个;GO 富集分析发现:有416个 GO term 有富集现象,包括156个生物学过程(66402个 Unigenes),89个细胞组分(27645个 Unigenes)和154个分子功能(73417个Unigenes);KEGG 代谢通路分析将烟粉虱转录组1145个 DEG 匹配到309个通路上,其中76个通路得到了富集。【结论】对405个可能参与到烟粉虱若虫对白僵菌侵染的免疫识别和防御的基因进行了测序。研究结果为从分子水平上开展应用虫生真菌防治烟粉虱的研究奠定信息学基础。
白僵菌、侵染、烟粉虱、转录组
Supported projects现代农业产业技术体系CARS-25-B-07;北京市科技计划课题Z121100001212006
2015-03-25(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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