基于COⅠ基因的二化螟种群遗传多样性检测方法

摘要：

[目的]建立二化螟Chilo suppressalis (Walker)遗传多样性检测与分析方法,以研究转基因水稻是否会对二化螟(靶标昆虫)种群遗传多样性产生显著影响.[方法]从江西、湖南两地采集的二化螟样本中,各随机挑选12只,提取基因组DNA,克隆CO Ⅰ基因的35～ 692 bp区段(658 bp)进行测序;同时,采用PCR-DGGE技术分析江西3个样本的CO Ⅰ基因遗传多样性,以获取样本群体遗传多样性信息.[结果]对158个CO Ⅰ基因克隆测序结果分析发现,在658 bp的区段中,共有173个位点存在多态,江西二化螟种群的单倍型多样度(h)为0.820,而湖南二化螟种群的单倍型多样度(h)仅为0.542,江西二化螟CO Ⅰ基因多态要比湖南样本丰富.对CO Ⅰ基因1 278～1 493 bp区段(266 bp)进行DGGE分析,共获得5条清晰条带,将分析的3只二化螟样本分成两类,该结果与基因测序结果一致.[结论]测序方法可以获得丰富、详细的二化螟目标基因多态信息,但工作量、实验周期及成本较高;DGGE方法虽然信息量较小,但有通量大、实验周期短、成本低等优点,因此该方法适用于二化螟等昆虫大样本种群遗传多样性研究.本研究建立的方法可以为判断转基因水稻是否会对靶标、非靶标昆虫的遗传多样性产生影响提供可靠的分子依据.

关键词：二化螟、转基因水稻、COⅠ、遗传多样性、DGGE

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资助基金：转基因生物新品种培育重大专项2012ZX08011002

在线出版日期：2014-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：1237-1245