昆虫RNA-Seq数据的分析流程

摘要：

随着高通量RNA测序(RNA-Seq)技术的发展和测序成本迅速下降,RNA-Seq技术已经成为生物学研究的重要工具,为生物学家全面地了解和研究转录组提供了机遇.高通量测序具有读长短、存在一定比例的测序错误、数据量大等特点,因此RNA-Seq数据分析与基因组分析和传统的EST数据分析有所不同.本文通过介绍不同的测序平台、原始数据产生和低质量数据过滤的计算流程,对短序列比对、转录组拼接、功能注释、以及差异表达分析进行了研究和分析,最后对RNA-Seq在昆虫学研究中的应用进行了综述,并对RNA-Seq技术进行了总结和展望.

关键词：高通量RNA测序、段序列比对、转录组拼接、基因功能注释、基因表达定量、基因差异表达

所属期刊栏目：50

资助基金：国家自然科学基金31171843;国家高技术研究发展计划"863"计划2012AA101505

在线出版日期：2013-11-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1458-1468