线粒体基因组数据的分析方法和软件

摘要：

线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础.本文以Staden Package软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件ContigExpress、DNAMAN、DNASTAR、BioEdit和Sequencher,以及利用不同软件(包括DOGMA、MOSAS、MITOS、GOBASE、OGRe、MitoZoa、tRNAscan-SE、ARWEN、BLAST和MiTFi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rRNA、tRNA和A+T富集区进行注释的方法,最后介绍了利用MEGA5软件分析线粒体基因组的组成、Sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(CG view、MTviz和OGDRAW).

关键词：线粒体基因组、拼接、注释

所属期刊栏目：50

资助基金：国家自然科学基金31172076,30970346

在线出版日期：2013-04-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：298-304