赤拟谷盗全基因组和EST中微卫星的丰度

摘要：

微卫星是近年大力开发的一种分子标记,为了推进赤拟谷盗Tribolium castaneum(Herbst)遗传学相关研究,对赤拟谷盗全基因组和EST中由1～6个碱基重复单元组成的简单序列重复进行分析,进而对其微卫星的丰度和分布进行比较分析.微卫星在赤拟谷盗EST中的分布频率为I/0.87 kb,其中单碱基重复序列占71.25%,是最丰富的重复单元,而六、三、四、二,五碱基重复单元序列分别占23.93%,2.94%,1.56%,0.17%,0.15%.全基因组中微卫星的分布频率为1/3.65 kb,其中六碱基重复序列占61.96%,是最丰富的重复单元,而三,四,一,五,二碱基重复单元序列分别占14.35%,13.75%,4.68%,3.60%,1.69%.同时发现富含A和T碱基的微卫星占主导地位,富含G和C碱基的微卫星数量较少.进一步的分析显示,微卫星在每条染色体上的丰度存在很大的相似性.

关键词：微卫星、赤拟谷盗、基因组、EST、丰度

所属期刊栏目：45

分类号：Q96(昆虫学)

资助基金：陕西省自然科学基金2005C113

在线出版日期：2008-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：38-42