鳞翅目基因组ⅡB型内切酶位点的统计分析

摘要：

ⅡB型限制内切酶能够识别并切割特异酶切位点两端特定距离的DNA,形成粘性末端的30 bp左右的等长DNA片段.利用其特性与限制性酶切位点关联测序技术(RAD)相结合发展出2b-RAD简化基因组测序技术,应用于遗传图谱构建、种群遗传结构分析、性状定位以及细菌分型等多种研究领域.构建2b-RAD测序文库之前,需要对基因组中的ⅡB型限制内切酶位点进行预测与统计分析,制定有效的测序文库构建方案.本文利用Python语言构建分析基因组中ⅡB型限制内切酶位点的流程,预测并统计6个鳞翅目代表物种基因组含有的8个商业化ⅡB型限制内切酶的酶切位点,比较了各个基因组与ⅡB型限制内切酶之间含有的酶切位点总量、重复序列数量以及酶切间隔长度的关系,为在昆虫基因组中进一步试行2b-RAD研究提供了参考.

关键词：鳞翅目、ⅡB型内切酶、基因组、预测、统计

所属期刊栏目：40

分类号：Q963;S433.4(昆虫学)

资助基金：国家自然科学基金31371932;广东省科学院青年科学研究基金qnjj201602;广东省科学院科技发展专项2017GDASCX-0107

在线出版日期：2018-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：894-900