云南切梢小蠹微卫星的高通量发掘

摘要：

基于构建获得的云南切梢小蠹转录组数据库,利用MISA (MicroSatellite)软件对其微卫星进行了高通量发掘.在32595681 bp的转录组序列中,共发掘获得1098个微卫星序列.在这些微卫星序列中,单核苷酸和三核苷酸微卫星重复单元最为丰富,分别为420和482个;六核苷酸的微卫星重复单元的丰度最小,仅有3个.就重复序列而言,以A/T单碱基重复序列最多,有367个;其次是AAT/ATT和ATC/ATG三碱基序列,有83个;最少的是CG/CG二碱基序列,有2个.研究结果为开发高多态性微卫星引物来进行云南切梢小蠹种群遗传结构、种群遗传多样性、功能基因组学等研究奠定了基础.

关键词：云南切梢小蠹、微卫星、重复单元、重复类型

所属期刊栏目：36

分类号：Q963;S433.5(昆虫学)

资助基金：云南省教育厅科学研究基金项目2012Y379;西南林业大学科学研究基金面上项目111128;云南省中青年学术技术带头人后备人才培养项目2013HB007

在线出版日期：2014-05-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：166-170