基于TCGA和GEPIA数据库分析CENPK基因在前列腺癌中的表达及临床意义

摘要：

目的 探讨着丝粒蛋白K基因(CENPK基因)在前列腺癌中的表达及其临床意义.方法 通过下载癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达谱数据交互分析(GEPIA)数据库相关数据,获得498例前列腺癌患者的mRNA表达水平及临床信息,其中52例患者有配对的癌组织与癌旁组织.分析前列腺癌组织中CENPK基因mRNA表达水平,分析不同特征前列腺癌患者CENPK基因mRNA表达水平,比较CENPK基因高表达组与CENPK基因低表达组总体生存时间(OS)及无进展生存期(DFS),基因富集分析明确CENPK基因调控的相关信号通路.结果 498例前列腺癌患者的癌组织和癌旁组织中CENPK基因mRNA的表达水平分别为3.9247±1.0929和3.4066±1.1545,差异有统计学意义(t=3.235,P=0.001).52例配对的前列腺癌组织和癌旁组织中CENPK基因mRNA的表达水平分别为8.2071±0.2952和3.4066±1.1545,差异有统计学意义(t=28.309,P<0.001).受试者工作特征(ROC)曲线分析显示CENPK基因可作为一个灵敏度和特异度较高的前列腺癌诊断指标(灵敏度为60.8％,特异度为63.5％,曲线下面积为0.625,95％CI为0.785～0.852).有生化复发、PSA>4 ng/mL、Gleason评分>7分、有肿瘤残留、T分期为T3～T4期、有淋巴结转移的前列腺癌患者CENPK基因mRNA高表达率明显高于无生化复发、PSA≤4 ng/mL、Gleason评分≤7分、无肿瘤残留、T分期为T1～T2b期、无淋巴结转移的前列腺癌患者,差异有统计学意义(P<0.05).CENPK基因高表达组OS及DFS明显短于CENPK基因低表达组,差异有统计学意义(P=0.045、0.003).基因富集分析显示,CENPK基因可能通过碱基切除修复、核苷酸切除修复、基因复制、剪接体、错配修复等通路影响前列腺癌的发生、发展.结论 CENPK基因在前列腺癌组织中呈高表达,且与临床特征及预后关系密切,可作为前列腺癌较好的诊断标志物.

关键词：前列腺癌、着丝粒蛋白K基因、癌症基因组图谱、基因表达谱数据交互分析、生物信息学

所属期刊栏目：20

分类号：R737.25(肿瘤学)

资助基金：广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题;广西壮族自治区卫生健康委员会自筹经费科研课题

在线出版日期：2023-03-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：455-459