先天性心脏病新生儿血浆circRNAs芯片数据的生物信息学分析

摘要：

目的 利用高通量检测技术探讨新生儿先天性心脏病(CHD)的发病机制.方法 将CHD新生儿血清与正常健康新生儿血清各3份进行配对分析,用微阵列探针进行环状RNA(circRNAs)检测.结果 共检测到1711个circRNAs,其中差异表达的circRNAs 375个,在CHD新生儿血清中表达上调的circRNAs 115个,下调的circRNAs 260个(FDR>2,P<0.05).通过美国Arraystar公司的微小RNA(miRNA)结合位点预测软件,该研究对每个差异表达的circRNA预测5个高匹配值的miRNA结合位点,375个差异表达的cir-cRNAs预测结合了1546个miRNAs对14个miRNAs的靶基因进行信号通路分析,其中富集总分位于前3位的通路局灶性黏连、肌动蛋白细胞骨架调节、血管平滑肌收缩均与CHD的病理相关.通过hsa_circ_091419/miR-145/mRNA的网络图构建,该研究预测CHD相关的靶基因其34个,包括hsa-miR-145-3p的靶基因IT-GB8.结论 CHD的发病机制可能与circRNA和miRNA的上调或下调及circRNA-miRNA的共表达密切相关,具体涉及多种途径和多种细胞分子生物学过程的调控.

关键词：circRNAs、先天性心脏病、GO分析、信号通路、circRNA/miRNA/mRNA网络

所属期刊栏目：19

分类号：R446.9(诊断学)

资助基金：江苏省常州市卫生健康委员会重大科技项目ZD202031

在线出版日期：2022-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：2063-2067