洋葱伯克霍尔德菌群3种鉴定方法的比较

摘要：

为了比较VITKE 2 COMAPCT、VITEK MS质谱、16s rDNA基因测序3种方法鉴定洋葱伯克霍尔德菌群的异同,挑选15株从米面制品、 淀粉及其制品中分离得到的洋葱伯克霍尔德菌群的菌,分别用VITEK 2 COMPACT、VITEK MS质谱和16s rDNA基因测序进行鉴定.结果显示,VITEK 2 COMPACT只能鉴定到群水平,可信度88％—99％;VITEK MS质谱可鉴定到种水平,鉴定置信度99％;16s rDNA基因测序可鉴定到种水平,序列同源性能达到99％以上,但每株菌16s序列能匹配到2种以上洋葱伯克霍尔德菌群里的菌.所以,3种鉴定方法中,VITEK MS质谱法可鉴定出洋葱伯克霍尔德菌群里的不同种,该方法结果准确,时效性高,操作步骤简单.

关键词：洋葱伯克霍尔德菌群、VITEK2COMPACT、VITEKMS、16srDNA基因测序

所属期刊栏目：29

分类号：R446.5(诊断学)

资助基金：广东省食品药品监督管理局科技创新项目 2018ZDZ07、 2018ZDZ06

在线出版日期：2019-06-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：13-18,31