奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS基因测序及同源性分析

摘要：

通过设计能扩增奥尔森派琴虫和北海派琴虫ITS序列的特异性引物，对我国东南沿海8个地区养殖牡蛎中常见的两种派琴虫相应基因进行扩增、克隆和测序，并进行同源性分析。国内不同地区奥尔森派琴虫ITS序列的同源性超过99.3%，与国外分离株的同源性也在98.8%以上；种间同源性分析发现，奥尔森派琴虫与海水派琴虫和P.honshuensis的同源性较高，分别为94.2%和95.0%，与P.qugwadi的同源性最低，仅62.9%。深圳和三亚分离的北海派琴虫ITS序列有18个碱基存在差异，其中ITS-1有3个碱基差异，ITS-2有15个碱基差异，而5.8S高度保守，没有碱基差异；北海派琴虫与其他种类之间的差异主要表现在ITS-1和ITS-2区域；同源性比较发现，北海派琴虫的同源性在100%-97.9%之间，其中深圳北海派琴虫的同源性较低，为97.9%。种间同源性分析表明，北海派琴虫与奥尔森派琴虫的同源性较高，为89.4%，其次为海水派琴虫和P.honshuensis，与P.qugwadi同源性最低，仅71.9%。

关键词：奥尔森派琴虫、北海派琴虫、ITS基因、同源性分析

分类号：S944.4(水产保护学)

资助基金：福建省自然科学基金项目2012J05065；国家质检公益专项项目201210055

在线出版日期：2014-03-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：62-67