海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库的建立

摘要：

目的 建立海洋细菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱鉴定数据库,为海洋细菌引起各类感染的病原快速鉴定提供支持.方法 本中心课题组2006-2016年收集国内外6个海域158个采样点海洋细菌530株,分离培养后进行细菌16srDNA扩增测序,应用FlexControl软件收集蛋白谱图,Biotyper软件构建评价数据库.分别用仪器商品化数据库、自建数据库和扩展数据库进行菌种鉴定,比较各数据库的鉴定差异.结果 自建本地化海洋细菌鉴定数据库包含32个菌属,82个菌种,共计421株海洋细菌谱图.以16srDNA测序鉴定结果 为金标准,验证菌株用商品化数据库鉴定时正确80株,鉴定正确率80.8％,用扩展数据库鉴定时正确97株,鉴定正确率98.0％,差异有统计学意义(P<0.001).结论 自建海洋细菌鉴定数据库菌株的鉴定能力较商品化数据库更强,有助于海洋细菌引起相关感染的诊断和治疗.

关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱、海洋细菌、细菌鉴定数据库、病原菌、微生物

所属期刊栏目：41

分类号：R446.5(诊断学)

资助基金：国家科技重大专项子任务;中央军委后勤保障部军队后勤科研重点项目

在线出版日期：2020-09-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：719-723