铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株全基因组序列测定与分析

摘要：

目的 全基因组测序和分析铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株,研究空间因素对细菌全基因组的影响,为宇航员的保健奠定基础.方法 通过革兰染色鉴定LCT-PA220属性,提取基因DNA、构建文库并上机测序;加工处理原始测序数据后进行基因组组装、注释和分析.结果 铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株革兰染色阴性,基因组为6.87M,包括5 829个编码序列,平均长度为962 bp,预测到为54个tRNA基因,COG数据库和KEGG数据库比对共注释到22组COG功能和32条KEGG信号通路.结论 铜绿假单胞菌LCT-PA220菌株全基因组测序和基因组清楚,为后续对该菌株的研究打下了基础.

关键词：铜绿假单胞菌、基因组、测序、编码序列

所属期刊栏目：35

分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家“973”重点基础研究发展规划项目2014CB744400;全军医学科研“十二五”课题重点项目BWS12J046;武器预研重点基金9140A26040312JB10078;National "973" Program for Basic Science Research Development of China2014CB744400;the Military Special-purpose Program of "Twelfth Five-Year"BWS12J046

在线出版日期：2014-07-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：738-740,758