浅低温体外循环手术前后基因表达研究中内参基因的选择

摘要：

目的 筛选浅低温体外循环(cardiopulmonary bypass,CPB)手术前后基因表达变化研究的内参基因.方法 通过阅读文献选择基因表达研究中常用的11个管家基因(housekeeping genes,HKGe),采用Beacon Designer软件设计PCR引物;收集4例浅低温CPB辅助手术患者CPB前、体温最低点、CPB末以及术后1d、3d、7d的静脉血24份,提取总RNA,采用SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR法检测各样品中11个HKGe的循环阚值;对所得循环阈值进行转换,采用geNonn程序对候选基因的表达稳定性和所需内参基因数量进行分析.结果 11个HKGs稳定性排序为:UBC<RPLP0<PGK1<18S-rRNA<PPIA<GAPDH<ACTB<TBP<B2M<EEF1A1/HPRT1;该研究需要的最佳内参基因数量为3个,即EEF1A1、HPRT1和B2M.结论 确定了浅低温CPB手术前后11个HKGs中表达稳定性高的EEF1A1、HPRT1和B2M等3个基因为该条件下基因表达研究的内参基因.

关键词：体外循环、基因表达、内参基因、管家基因、geNorm程序

所属期刊栏目：30

分类号：R654.1(外科学各论)

资助基金：院苗圃基金项目07MP59

在线出版日期：2012-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共3页

页码：440-442