10.3969/j.issn.1001-8581.2014.01.006
萝卜硫苷生物合成相关基因 RsFMOGS-OXs的预测及分析
以控制拟南芥硫苷生物合成相关基因家族FMOGS-OXs全长cds为参考序列,在萝卜ESTs数据库中进行blastn检索,得到具备Score≥100、E-value≤10-10和coverage ≥70%条件的24条萝卜ESTs作为候选的拟南芥FMOGS-OXs基因的同源ESTs,并进行序列聚类拼接、注释及分析。结果显示:在萝卜中发现两个旁系同源基因( RsFMOGS-OXa和RsFMOGS-OXb )。RsFMOGS-OXs与拟南芥FMOGS-OXs间在核酸水平上的一致性为68.0%~83.2%;RsFMOGS-OXs旁系同源基因间的一致性仅为67.3%;RsFMOGS-OXs与白菜FMOGS-OXs同源基因间的一致性为67.3%~92.9%。系统进化分析发现,RsFMOGS-OXa和白菜FMOGS-OX2基因亲缘关系最近,而RsFMOGS-OXb和白菜FMOGS-OX5a亲缘关系更近一些,同时认为,RsFMOGS-OXa和RsFMOGS-OXb的直系同源基因分别为FMOGS-OX2和FMOGS-OX5。
十字花科、萝卜、硫代葡萄糖苷、FMOGS-OX
S631.1(蔬菜园艺)
江苏省农业科技自主创新项目[CX125043];江苏省农业科技支撑计划项目BE2012342。
2014-01-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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