一个新的枳NAC基因cDNA全长的克隆及其亚细胞定位分析

摘要：

以拟南芥的NAC1 cDNA序列作为模板,对柑橘EST数据库进行同源检索筛选,利用生物信息学方法克隆了柑橘NAC1基因的cDNA序列.以枳(Poncirus trifoliata)花的cDNA为模板,根据以上cDNA序列设计特异性引物,利用5′RACE和3′RACE技术,分别获得了NAC1基因的5′和3′末端,序列拼接后获得枳的NAC1 cDNA全长,命名为Pt-NAC1.Pt-NAC1全长为1351 bp,含有1个1047 bp完整的开放读码框(ORF),5′末端起始密码子ATG起始于25 bp,3′末端非翻译区为280 bp.该cDNA推导编码348个氨基酸,与苹果、拟南芥、杨树中相应序列的同源性分别为64.8％、57.0％、61.3％.生物信息学分析 结果表明:Pt-NAC1 cDNA序列中有miRNA164的识别位点,还有高度保守的NAC结构域.构建Pt-NAC1亚细胞定位载体35S-GW-GFP-FJ619349,用基因枪转化洋葱表皮细胞,亚细胞定位结果表明:Pt-NAC1均定位于细胞膜中.

关键词：枳、Pt-NAC1、基因克隆、亚细胞定位

所属期刊栏目：24

分类号：Q785(基因工程（遗传工程）)

资助基金：教育部科学技术研究重点项目109084;江苏省2009年度高校研究生科研创新计划项目CX09B_238Z

在线出版日期：2012-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1-6