苹果SBP基因家族生物信息学分析

摘要：

首先利用生物信息学方法对苹果42条SBP蛋白序列的系统发生和SBP基因组定位进行分析,然后对其氨基酸组成成分、理化性质以及二级和三级结构进行预测和分析,同时还分析了苹果与拟南芥的SBP基因家族之间的联系.结果显示着42条蛋白序列与拟南芥16条SBP蛋白序列一起被分成了7个亚族,拟南芥与苹果SBP基因间具有较高的保守性.基因组定位结果显示42条SBP基因分布在12条染色体上.研究还发现不同亚族间氨基酸数目、氨基酸序列疏水性存在一定的差异；二级结构预测分析发现,42条氨基酸序列以随机卷曲和α-螺旋为主要组成部分,而且42条氨基酸序列三维结构相似.

关键词：苹果、SBP基因家族、氨基酸序列、生物信息学

所属期刊栏目：23

分类号：S661.1(果树园艺)

资助基金：国家苹果产业技术体系项目品种选育岗位CARS-28-01-07;山东省良种产业化工程项目

在线出版日期：2012-04-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：23-27