基于RNA-Seq技术分析微囊藻毒素-LR对草鱼肝脏脂质代谢的影响

摘要：

[目的]为探讨微囊藻毒素-LR(MC-LR)对草鱼肝脏脂质代谢的影响机制,对已获得的草鱼肝脏转录组数据进行了挖掘分析.[方法]草鱼经腹腔注射不同剂量(0,25,75,100μg/kg)MC-LR 96 h后,分离肝脏提取RNA,依托IlluminaHiseq-2500平台进行转录组测序分析,将筛选到的差异表达基因(DEGs)进行KEGG Pathway分析.同时利用荧光定量PCR(qRT-PCR)对随机选取的3个DEGs的表达模式进行验证.[结果]25,75,100μg/kg 3个实验组中的脂质代谢相关DEGs分别有37、363和132个.75μg/kg和100μg/kg 2个实验组中的DEGs分别富集到脂肪酸分解代谢等15个脂质代谢通路上.而25μg/kg实验组中DEGs富集到12个脂质代谢通路上,和其它2个剂量相比,脂肪酸合成通路、不饱和脂肪酸合成通路以及脂肪酸延长通路中没有DEGs.PPAR信号通路作为脂质代谢的关键调控通路,在3个MC-LR处理组中也有大量DEGs,其共同DEGs主要有PPARα、FABP、CYP7A1和LPL等7个基因.qRT-PCR结果显示PPARα、LPL和CPT1表达结果与转录组测序结果趋势一致.[结论]通过对转录组测序数据的深入挖掘,分析得到了大量草鱼肝脏脂质代谢相关通路和DEGs,表明MC-LR干扰了草鱼肝脏脂质代谢,另外,部分DEGs有望被开发为鉴定MC-LR干扰鱼类脂质代谢的分子标记.

关键词：草鱼;肝脏;脂质代谢;微囊藻毒素-LR;转录组测序

所属期刊栏目：44

分类号：S949(水产保护学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金

在线出版日期：2022-02-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：166-174