湿地松左旋β-蒎烯合成酶基因PeTPS-(-)BPin的同源克隆及生物信息学分析
通过火炬松等松属树种的cDNA序列同源克隆了湿地松的左旋β-蒎烯合成酶基因( PeTPS-(-) BPin),分析表明该基因与其他松属植物之间的同源性在90%以上,与松科其他属植物之间的同源性在80%以上。裸子植物不同萜烯合成酶基因( TPS)之间的同源性在70%以上。被子植物与裸子植物的TPS基因亲缘关系较远。左旋β-蒎烯合成酶的蛋白质分子式为C3197H4972N862O957S32,分子量为71.74 ku,带弱正电,为不稳定蛋白,易分解,含37个磷酸化位点,定位在叶绿体。蛋白质二级结构含有4个不规则卷曲,24个α-螺旋,三级结构中含有一个cd00684保守域。 ELM中找到7个可能的功能域,包括一个NDR切割位点、两个磷酸肽配体、一个PDZ配体、一个SH2配体、两个磷酸化位点。在68、69位存在一个RR保守结构,猜测能够在第二个R的N末端断裂并与底物结合,从而参与底物异构化。在380~384位出现了DDxxD保守域,但未能在该区搜到可能的功能位点。预测的两个磷酸化位点位于302、623位氨基酸。
湿地松、萜烯合成酶、同源克隆、β-蒎烯
Q785;S791.246.02(基因工程(遗传工程))
江西省林业厅林业科技创新专项201401;广东省森林种质创新与利用重点实验室开放基金2014-5;中央财政林业科技推广示范资金项目[2010] JXTG-9
2015-05-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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