水稻细菌性谷枯病菌的分子鉴定及16S rDNA序列分析

摘要：

为准确鉴定水稻细菌性谷枯病病原菌，并明确其分类地位，本研究利用16S rDNA通用引物对该病菌进行了PCR扩增，克隆了其16S rDNA片段，并基于该序列对该病菌进行了分子鉴定，进而通过序列比对与系统发育分析，研究了其16S rDNA片段与近缘菌的序列差异及系统发育关系。结果表明：水稻细菌性谷枯病菌各菌株均能扩增得到1600 bp左右的条带；BLAST比对结果显示，其序列与颖壳伯克氏菌（ Burkholderia glumae）同源率为100％，将其鉴定为颖壳伯克氏菌（ B．glumae）；B．glumae与B．metallica、B．stabilis、B．cepacia、B．vietnamien-sis、B．plantarii、B．gladioli及B．cocovenenans的16S rDNA序列存在明显的差异性区域，主要集中在180～210 bp、440～470 bp、580～590 bp、640～650 bp、1000～1040 bp、1130～1150 bp和1240～1250 bp。 B．glumae与B． plantarii、B．cocovenenans及B．gladioli的亲缘关系较近，聚为一个组群，其它菌株则聚为另一个组群。

关键词：水稻细菌性谷枯病、颖壳伯克氏菌、16S rDNA、克隆、序列分析、系统进化

分类号：S435.11.4(病虫害及其防治)

资助基金：国家重点基础研究发展计划项目2011CB111603;国家公益性行业农业科研专项201003074，201003031，201303021;江西省农业科学院创新基金项目2011CBS006

在线出版日期：2014-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：760-765