食用菌纤维素内切酶的分子建模与分析

摘要：

采用SWISS-MODEL、Discovery Studio等生物信息方法预测和分析食用菌纤维素内切酶(EG)分子的三级结构.结果显示:草菇(V.volvacea)和云芝(T.hirsuta)EG的分子外形呈“桶”状,由外层的alpha -螺旋和内层的beta-折叠组成,无规卷曲位于其2个底面；草菇EG的R129作为盐键形成中心,参与形成6个盐键,其催化残基E215和E248参与形成5个氢键,而里氏木霉(T.reesei) EG II的催化残基参与形成3个氢键.基于EG连接区和催化相关序列氢键分析,认为草菇和云芝的该区域相关碱基或氨基酸可进行突变和优化.目前未见对草菇和云芝EG的分子建模的研究报道.此研究对于食用菌纤维素内切酶结构的深入了解和结构优化及应用具有重要的意义和价值.

关键词：分子建模、纤维素内切酶、食用菌

所属期刊栏目：33

分类号：Q71(生物大分子的结构和功能)

资助基金：中央高校基本科研专项资金SWJTU09ZT28

在线出版日期：2011-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：584-588