番鸭呼肠孤病毒YB株σNS基因的克隆和序列分析

摘要：

参考GenBank鸡正呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)和番鸭呼肠孤病毒(Muscovy duck reovirns,DRV)σ非结构蛋白(σNS)基因序列设计合成1对引物,对番鸭呼肠孤病毒YB(DRV-YB)株σNS基因进行RT-PCR扩增,克隆到pMD18-T载体中,并对克隆产物进行PCR鉴定和测序; DRV-YB株编码σNS的基因全长为1 191 bp,其5' 和3' 端具有典型的禽正呼肠孤病毒的特征,开放阅读框从24～1 127位碱基,编码367个氨基酸残基.DRV-YB株与法国番鸭呼肠孤病毒89026(DRV-89026)株和鸡呼肠孤病毒S1133(ARV-S1133)株σNS基因核苷酸同源性分别为87.3%和76.5%;推导氨基酸同源性分别为94.8%和 90.5%.进化树分析表明DRV-YB株σNS与DRV-89026株亲缘关系较近,处在番鸭呼肠孤病毒的分支上.分析发现DRV-YB株S组基因大小和编码蛋白与法国番鸭呼肠孤病毒89026、89330株S组一致,具有法国番鸭呼肠孤病毒89026、89330株S组的特征,而与ARVS1133、176等鸡源呼肠孤病毒差异较大.表明不同禽正呼肠孤病毒株S组基因的大小和编码同一蛋白的等位基因呈现多态性,自然界中禽正呼肠孤病毒不同毒株之间存在基因交换和基因重组现象.

关键词：番鸭呼肠孤病毒、σNS基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：33

分类号：S852.65+9.4(动物医学（兽医学）)

资助基金：福建省自然科学基金重大项目2002F003

在线出版日期：2011-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：128-136