甘蔗花叶病毒南城分离物外壳蛋白基因序列测定及分析

摘要：

从江西南城甘蔗病株中获得1个甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus, SCMV)分离物,命名为SCMVNCH.根据SCMV外壳蛋白(CP)基因N-端和C-端保守序列设计引物,对SCMV-NCH的CP基因进行RTPCR扩增、克隆和测序,获得924个核苷酸(nt),推断编码308个氨基酸(aa)的近全长CP基因序列.与SCMV亚组SCMV、高粱花叶病毒(SrMV)、玉米矮花叶病毒(MDMV)、约翰逊草花叶病毒(JGMV)、玉米花叶病毒(ZeMV)、白草花叶病毒(PenMV)等6种病毒代表性株系外壳蛋白氨基酸序列同源性比较结果显示,SCMVNCH与SCMV的同源性最高(86.2%),与其他5种病毒同源性相对较低(56.4%～72.2%).与SCMV 13个分离物外壳蛋白氨基酸序列进行同源性比较并构建关系树,结果显示SCMV-NCH与我国浙江2个分离物(Yuhang和Xiaosh)具有最近的亲缘发生关系.

关键词：甘蔗花叶病毒、外壳蛋白基因、序列测定、亲缘关系分析

所属期刊栏目：30

分类号：S432.4+1;S566.1(病虫害及其防治)

资助基金：江西省自然科学基金资助项目0330077

在线出版日期：2008-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：464-467