用于灵芝属10个物种快速鉴定的DNA条形码筛选与验证
灵芝栽培品种常出现同名异物或同物异名的现象,依赖于灵芝的形态学特征鉴定物种的传统分类方法不足以鉴定物种的种间和种内差异.为开发简便而准确的分子水平灵芝属物种鉴定方法,以常用于种属鉴定的核糖体内转录间隔区(ITS)、微管蛋白基因(β-tubulin)片段、大亚基核糖体DNA(LSU)片段和基因编码RNA聚合酶Ⅱ第二大亚基(RPB2)片段4个DNA条形码,对灵芝属10个物种的44份菌株进行PCR扩增和测序,比较4个条形码的扩增成功率和变异率,根据种内、种间遗传距离差异分析筛选特异性的DNA条形码间隔(DBG),并利用单独及联合条形码构建系统发育树验证筛选的DBG鉴定灵芝属物种的准确性.研究结果表明:β-tubulin和LSU片段的PCR扩增成功率均达100％,ITS和RPB2片段分别为95.35％和90.91％;对比ITS和LSU片段,β-tubulin和RPB2片段的种内最大遗传距离分别小于各自的种间最小遗传距离,存在明显的DBG,有利于准确对物种进行种间鉴定;利用ITS、β-tubulin和RPB2片段分别构建的系统发育树均能使灵芝属10个物种的所有个体聚为1个单系分支,而LSU片段不能准确区分所有供试菌株.与其他3种条形码综合相比,β-tubulin片段更适用于灵芝属种间鉴定.
灵芝属、快速鉴定、β-tubulin片段、遗传距离、条形码间隔
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Q949.329(植物学)
吉林省科技发展计划国际合作项目;吉林省科技发展计划项目;吉林农业大学校企合作项目
2023-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
214-224
