基因组测序分析广叶绣球菌SP-A菌株的遗传差异

摘要：

广叶绣球菌Sparassis latifolia是一种极具开发潜力的食药用真菌,新品种的选育是其产业发展的迫切需求.绣球菌新品种'SP-A'是福建省农业科学院选育的绣球菌工厂化栽培新品种,但由于缺少基因组信息,严重阻碍了其相关基础研究.本研究利用高通量测序技术,对'SP-A'全基因组进行测序,获得了1.58Gb高质量测序数据,Q30达到95.55％.与'闽绣1号'参考基因组平均比对率为76.86％,平均覆盖深度为28X,基因组覆盖度为93.51％,共检测到273587个单核苷酸多态位点,40772个小片段插入缺失位点,这些变异共导致了7954个基因变异.研究初步揭示了'SP-A'的基因组特征,为相关分子标记筛选及辅助育种、遗传分析和功能基因克隆提供了重要的分子标记资源.

关键词：绣球菌;基因组;测序;单核苷酸多态位点;小片段插入缺失

所属期刊栏目：40

分类号：S511;S858.28;Q943.2

资助基金：福建省公益类科研院所专项;福建省公益类科研院所专项;福建省自然科学基金;福建省种业创新与产业化工程项目;福建省农业科学院自由探索项目;福建省农业科学院创新团队

在线出版日期：2022-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：3246-3255