比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

摘要：

采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性.结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属.AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著.与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善.

关键词：AM真菌、形态学方法、二代测序、群落结构和多样性、荒漠生境

所属期刊栏目：37

资助基金：国家自然科学基金31270460,31470533;河北省自然科学基金C2014201060

在线出版日期：2018-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1170-1178