明尼苏达被毛孢中活跃扩张的HmHeli1转座元件
Helitron是真核生物中存在的一种以滚环方式进行复制的转座元件,关于其对动植物基因组的影响已有深入分析,而在真菌中则鲜有报道.本文对大豆囊孢线虫的生防菌——明尼苏达被毛孢Hirsutella minnesotensis中的Helitron转座元件进行了系统分析,发现该真菌中存在两类自主的Helitron元件HmHeli1和HmHeli2;其中HmHeli1不仅具有保守的末端序列和结构,而且编码序列高度相似,甚至完全一致的RepHel转座酶,表明其在基因组中发生了近期扩张并依旧活跃.HmHeli1符合Helitron2元件的结构及编码特征:5'和3'末端分别存在保守序列“TCAG”和“TATTrT”,3'末端存在富含GC的发卡结构,近末端存在不对称的反向重复序列;编码的转座酶包含锌指、Rep和Helicase结构域,但不包含核酸内切酶结构域.HmHeli1优先同向插入基因富集区,甚至功能基因内部,插入位点存在一个短的富含AT的序列.HmHeli1不具主动捕获基因的能力,但可被动接受其他转座元件的插入.HmHeli1是一种结构独特、极具扩张力的DNA转座元件,不仅在明尼苏达被毛孢基因组进化中发挥着重要作用,并且具有开发为通用遗传分析工具的潜能.
明尼苏达被毛孢、HmHeli1、Helitron2、末端反向重复、基因富集区
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S56;S43
中央高校基本科研业务费专项2014YB032;宁陕科技合作项目 Supported by the Fundamental Research Funds for the Central Universities2014YB032;the Project of Ning-Shaan Science and Technology Cooperation
2017-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
1392-1405
