生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株抗原表位

摘要：

目的 通过生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株的抗原表位,为病毒抗原表位多肽疫苗的设计开发提供依据.方法 以新冠病毒Omicron变异株(GenBank:OM095411.1)为研究对象,利用生物信息学服务器和免疫学工具预测新冠病毒S、M、N、E蛋白的杀伤性T细胞表位、辅助性T细胞表位和线性B细胞表位.同时,基于免疫表位数据库(IEDB)、抗原性预测(Vaxigen)、致敏性预测(AllerTOP)等表位生物学性质分析数据库对候选表位进行生物学性质分析.结果 筛选得到具有抗原性、无毒性或致敏性的杀伤性T细胞表位38个、辅助性T细胞表位15个和线性B细胞表位6个,主要位于S蛋白和M蛋白.结论 抗原表位的预测筛选方法可行,研究筛选出的候选表位,可为开发针对新冠病毒Omicron变异株多肽疫苗提供借鉴.

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒2、Omicron变异株、抗原表位、生物信息学

所属期刊栏目：46

分类号：R318.04;R373.19(医用一般科学)

资助基金：国家自然科学基金82171814

在线出版日期：2023-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：896-900,917