新疆旱獭肠道RNA病毒的宏转录组学研究

摘要：

目的 了解新疆地区旱獭(Marmota)肠道携带RNA病毒的病原本底.方法 采用宏转录组学方法对新疆喀什地区14只健康旱獭肠道样品进行病毒组分析.结果 基于重叠序列(contig)水平共注释到5个脊椎动物病毒科,分别为星状病毒科、小RNA病毒科、呼肠孤病毒科、圆环病毒科和腺病毒科.根据病毒宏转录组学结果,对注释到的病毒进行检测与进化分析,发现心病毒、嵴病毒、摩萨病毒与参考毒株同源性较高,为这些病毒变异株,而肠道病毒、腺病毒与已知病毒具有明显的遗传差异,可能为该病毒新种;星状病毒与其他旱獭源星状病毒之间氨基酸同源性差异较大,显示星状病毒在旱獭体内具有遗传多样性.值得注意的是,旱獭轮状病毒与牛轮状病毒核苷酸同源性高达92％,表明该病毒可能经过粪口途径实现跨种传播.结论 该研究揭示了旱獭肠道携带RNA病毒的多样性,为了解旱獭病毒本底、监测病毒传播生态链提供了重要数据.

关键词：新疆、旱獭属、宏转录组学、RNA病毒、进化分析

所属期刊栏目：46

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金32022083

在线出版日期：2022-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：534-539